다른 질환과 동반된 배뇨통 및 전립선통증
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만약 다른 원인질환이 확인되는 경우에는 질환별로 맞춤 치료를 시행한다.
또한 만성골반통증후군은 종종 전립선암 및 방광암과 같은 비뇨생식기계 악성종양, 요로결석, 성전파성질환, 소화기계질환이나 근골격계질환과 같은 질환들의 가능성을 배제함으로서 진단되는 경우가 있다. 만성골반통증후군은 감염이 없을 때 혹은 밝혀지지 않았을 때 진단된다. 만성골반통증후군 환자의 경우 회음부 통증과 동반된 배뇨증상 및 성기능부전을 호소하는데 이와 같은 증상은 환자의 삶의 질에 큰 악영향을 주게 된다. 이러한 만성골반통증후군을 진단하기 위해서는 증상발현기간이 최소 3개월 이상은 되어야 한다.